Секвенатор OXFORD NANOPORE TECHNOLOGIES GridION Mk1
+7 495 513-13-54
+7 383 383-05-38
0
0
+7 495 513-13-54
+7 383 383-05-38
Секвенатор OXFORD NANOPORE TECHNOLOGIES GridION Mk1

Секвенатор OXFORD NANOPORE TECHNOLOGIES GridION Mk1

GridION – нанопоровый секвенатор производства компании Oxford Nanopore Technologies с максимальной производительностью до 150 млрд. нуклеотидов за один запуск и без ограничений по длине прочтений.
В корзину
Oxford Nanopore
PDF БРОШЮРА
связаться с нами
Секвенатор OXFORD NANOPORE TECHNOLOGIES GridION Mk1
Секвенатор OXFORD NANOPORE TECHNOLOGIES GridION Mk1
  • Описание
  • Характеристики
  • Видео
Описание
Ключевые характеристики
Главные преимущества GridION:
  • Относится к 3-му поколению NGS-секвенаторов.
  • Одновременный и независимый процессинг от 1 до 5 проточных ячеек.
  • На разных ячейках можно секвенировать образцы, подготовленные по разным протоколам.
  • Простая и быстрая пробоподготовка без амплификации.
  • Длинные прочтения без ограничения по длине.
  • Низкая стоимость прочтения одного нуклеотида.
  • Возможность отслеживать параметры, контролировать процесс секвенирования и проводить бейсколлинг в реальном времени.
  • Небольшие размеры и вес прибора (36 х 36 х 20 cм, 11 кг).
  • Для работы не требуется внешней управляющей станции – она уже встроена в прибор.
  • Программное обеспечение для первичной и вторичной обработки данных установлено в приборе.
  • Встроенная управляющая станция обрабатывает данные в десятки раз быстрее, чем станционарный компьютер или ноутбук.
  • Возможность остановки запуска в любой момент времени.
  • Прибор не требует специального источника бесперебойного питания.
Программное обеспечение.
Программное обеспечение, необходимое для первичной и вторичной обработки данных (GridION Software и EPI2ME) уже установлено на приборе. Оно работает на ресурсах графического процессора, что позволяет в десятки раз ускорить сбор данных и бейсколлинг в реальном времени (по сравнению, например, с программой MinKNOW для MinION, работающей на ресурсах центрального процессора).

Интерфейс ПО, установленного на GridION, идентичен интерфейсу программ, используемым с другими секвенаторами Oxford Nanopore Technologies.

Области применения GridION.
  • Полногеномное секвенирование de novo и ресеквенирование.
  • Облегчение сборки данных, полученных на других секвенаторах.
  • Детекция хромосомных аберраций.
  • Исследование альтернативного сплайсинга.
  • Определение копийности определенных последовательностей.
  • Анализ экспрессии генов.
  • Углубленное исследование образцов бактериального метагенома (с предварительной амплификацией полного гена 16S рРНК).
  • Детекция модифицированных нуклеотидов.
  • Анализ профиля метилирования и др.
Паспорт и ключевые документы
Спецификация-Секвенатор-OXFORD-NANOPORE-TECHNOLOGIES-Серии-GridION-EN.pdf
English 23 Jul 2021 714.4 KB PDF
Характеристика-Секвенатор-OXFORD-NANOPORE-TECHNOLOGIES-Серии-GridION-EN.pdf
English 23 Jul 2021 157.61 KB PDF
Комплект поставки
В отличие от младшей модели нанопоровых секвенаторов MinION, в корпус GridION уже встроены все компоненты, необходимые для управления секвенированием и обработки данных:
  • SSD-диск: 4 Тб.
  • Оперативная память: 64 Гб.
  • Центральный процессор последнего поколения.
  • Ускорители на основе графического процессора (видеокарта Nvidia GV100, 100 Тфлопс).
  • ОС Linux.
  • Программное обеспечение для секвенирования и обработки данных.
  • Дополнительно к прибору требуется подключить только периферические устройства: монитор, мышь и клавиатуру.